プレゼンテーションの常識とRで描いたグラフの再描画方法を鑑みて、 PowerPointにRで描いた図を挿入する場合は、 図は縦が600ドットもしくは800ドットで用意しておけば十分です。 表示の際の解像度が粗いのが気になる人は、縦方向のドット数を1000ドットもしくは2000ドットで用意しておいて、 縮小をソフトウェアに任せれば良いです。
例えば800×600で用意する場合は、グラフを描くためのプログラムを
jpeg(filename="ファイル名",width=800,height=600) dev.off()
の間に書いて、実行します。
保存するファイルの大きさを考えると、bitmapやTIFFよりは、JPEGの方がお勧めです。